学园都市由统括理事会会长亚雷斯塔·克劳利花费数十年建立。位于日本国东京西部（也包括埼玉县和神奈川县一部分）的圆形城市，其陆地亦被日本包围。
政府将东京西区开发较慢的区域一次全部收购后，建立起这座“学园都市”，面积约东京都的三分之一。这个“学校之城”包含了数十所大学与数百所小学、初中及高中，总共有一千个以上的大小“研究机构”。人口将近230万，八成的居民（超过一百八十万）都是学生。“学园都市”拥有世界上最尖端的科技，比外界先进二三十年，是科学世界的领导者。学园都市的由统括理事长亚雷斯塔·克劳利花了超过五十年打造，由“统括理事会”全权管理。由于技术、研究多数都是高度机密事项，学园都市内的警戒体制非常严格，对人员进出有严格的限制。
学园都市是一个由二十三个学区构成的巨大的教育机构的集合体，以发掘超能力而提供特殊的教育课程，主要靠从外部招收学生。除了教育机构，还有面向学生研究设施，生产、商业设施，国际展示场，国际机场等等在都市内生活的所需要的生活设施都齐备。
学园都市基本上是采取排外政策，不仅被围墙所包围，而且还有专门阻挡入侵者的警卫部队。学园都市的内外周围随时有人造卫星在监视着。
学园都市的学生，大部分居住在学校的宿舍中，并在各个学校中接受能力开发。学园都市的学生大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。有各种类型不同能力，以范围和威力分为无能力者（level0）、低能力者（level1）、异能力者（level2）、强能力者（level3）、大能力者（level4）、超能力者（level5）、绝对能力者（level6），实际绝对能力者只是理论上存在进化为level6的可能，并没有哪一个角色成功进化为level6。并每隔一定时间会进行身体检查，重新测定一次，但学生中的六成是无能力者，而学园都市中超能力者也只有七人。
学园都市内部的区域划分，从第一到第二十三学区共23个，每个学区有不同的功用。此外还有像都市传说般存在的“虚数学区”。
第一学区
司法、行政机关四处林立的学区，经济、司法相关大学也位于这个区域，感受不到其他一般学区所拥有的生活气息。
第二学区
爆炸物或是武器的试验场、警备员和风纪委员的训练所所在的学区。第二学区是机密最多的学区。这个学区里四处林立着研究关于轿车和炸药等，能发出巨大噪音的研究机构。学区周围环绕着高耸的隔音墙，而且这地方还拥有能发射逆相位音波来消除噪音的设备。
第三学区
第三学区内有许多对外设施，有好几间国际展示场，饭店的档次在学园都市内也是数一数二。基于不让机场噪音影响住宿设施的考虑，学园都市特地将迎宾设施安排在距离机场集中的第二十三学区很远的第三学区，作为对外门户的第二十三学区里有铁道直通第三学区。
第四学区
第四学区集食品相关设施很多的学区，是学园都市内餐厅最多的场所[9]，全世界的美食都可以在这里找到。
第五学区
第五学区有很多一般大学跟短期大学。服饰店跟餐厅等的品位跟其他学区相比，有种比较成熟的气息。
第六学区
第六学区是娱乐设施集中的学区。有世界级的游乐园。
第7学区周边
第7学区周边
第七学区
第七学区是高中生和国中生为主的学区，上条的学校和宿舍，常盘台中学和栅川中学都在这个学区，亚雷斯塔的官邸也在这个学区。
第八学区
第八学区是由老旧商店街和新型大厦群相结合的教职员居住区。
第九学区
第九学区是由美术工艺相关学校的集中学区。
第十学区
第十学区在学园都市中，以地价最便宜，治安也最糟糕而闻名。因为这里地价便宜，所以充满各种“其他学区敬而远之”的设施，是个核能、细菌先关研究设施以及实验动物焚化场林立的学区。学园都市唯一的墓地和少年感化院就坐落在这个学区。
第十一学区
第十一学区面对学园都市东侧外墙，其位置是陆路最大的进出口，担任陆路的物流基地。一天有进出七千多吨物资的第十一学区，仓库街相当广阔。这个以物流最佳化、高速化为目标的学区，除了几名工程师以外全部自动化。
第十二学区
第十二学区是一个神学系学校集中并且有各国风情的街道并存的学区。
第十三学区
第十三学区是学院都市中，最多幼儿园与小学集中的学区。
第十四学区
第十四学区是留学生最集中的区域。
第十五学区
第十五学区既是学园都市最繁华的学区，也是各种流行元素的发源地。电视台和各种媒体机构林立在这个学区，也是整个学园都市地价最昂贵的地方。
第十六学区
第十六学区是有很多提供高薪打工机会的设施所在的商业规划区。
第十七学区
第十七学区位于学园都市的西部郊区，是片宽广的工业地带，大多是无人控制的自动工厂，人口极端的稀少。
学园都市有自己的工业地带，可以将自己所研发的实验品加以“商品化”。但是这里的工业地